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Analyses génétiques

Nous étudions, sur des populations naturelles, semi-naturelles ou en élevage, le polymorphisme génétique des individus et des populations grâce à l’analyse des microsatellites comme marqueurs génétiques.

Nous effectuons aussi des études de diversité bactérienne.

Méthode :
Après amplification par PCR (Polymeras Chaine Reaction), la taille des répétitions est analysée grâce à l’utilisation d’un séquenceur à 8 capillaires (ABI 3500 Applied Biosystems).

Ce service propose :

  • L’encadrement et la formation de toutes personnes devant avoir accès à la biologie moléculaire
  • La mise en place des protocoles expérimentaux nécessitant des analyses génétiques, leurs applications et les analyses qui s’en suivent
  • Participer à la conception, à l’exécution et la publication des recherches scientifiques

Techniques proposées :

  • Extraction d’ADN génomique à partir d’échantillons frais, congelés ou préservés dans l’alcool
  • Développement et sélection d’amorces pour des marqueurs microsatellites
  • PCR
  • Affinage des techniques et protocoles,
  • Mise au point de marqueurs microsatellites pour passage en multiplex sur le séquençeur
  • Utilisation et entretien du séquenceur 8 capillaires (ABI 3500, Applied Biosystems)
  • Gestion des fichiers de données brutes
  • Analyses préliminaires des résultats et transmission aux équipes

Matériel disponible  :

  • Sequenceur Applied Biosystems 3500 8 capillaires
    PNG - 1 Mo
  • Applied Biosystems GeneAmp PCR Systems 9700
  • Applied Biosystems GeneAmp PCR Systems 2700
    PNG - 742.5 ko
  • Hotte PCR
    PNG - 667.2 ko
PNG - 684.4 ko
  • Biophotometer Eppendorf
    (DS DNA, SS DNA, RNA, Proteine, Oligo, Bradford, OD 600, Lowry, BCA)
    PNG - 321 ko


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